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Diversidad genética en 105 accesiones de cacao (Theobroma cacao L.) colectadas en Nicaragua, utilizando 10 marcadores moleculares tipo SSR

Se realizó una caracterización molecular a 105 accesiones de cacao de 79 colectas nacionales, 21 híbridos de referencia y cinco materiales criollos de referencia agrupados en ocho grupos (Rio San Juan, Criollos referencia, híbridos referencia, Carazo, Rivas, Matagalpa, Jinotega y RAAS),...

Descripción completa

Autores Principales: Herrera García, Kenia, Aragón Obando, Erwin, Aguilar Bustamante, Víctor
Formato: Artículo
Idioma: Español
Publicado: Universidad Nacional Agraria 2015
Materias:
F30 Genética vegetal y fitomejoramiento
Acceso en línea: http://repositorio.una.edu.ni/3958/
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spelling RepoUNA39582020-01-22T22:44:43Z http://repositorio.una.edu.ni/3958/ Diversidad genética en 105 accesiones de cacao (Theobroma cacao L.) colectadas en Nicaragua, utilizando 10 marcadores moleculares tipo SSR Herrera García, Kenia Aragón Obando, Erwin Aguilar Bustamante, Víctor F30 Genética vegetal y fitomejoramiento Se realizó una caracterización molecular a 105 accesiones de cacao de 79 colectas nacionales, 21 híbridos de referencia y cinco materiales criollos de referencia agrupados en ocho grupos (Rio San Juan, Criollos referencia, híbridos referencia, Carazo, Rivas, Matagalpa, Jinotega y RAAS), utilizando 10 marcadores moleculares tipo SSR con el objetivo de conocer la diversidad genética del cacao colectado en fincas de productores nicaragüenses. Se utilizó el método de extracción de ADN CTAB-Búfer, amplificación de fragmentos de ADN mediante la técnica de la cadena de reacción de la polimerasa (PCR), visualización de fragmentos de ADN en cámara electroforesis. Se identificaron 183 alelos en las 105 accesiones con una media de 18.3, los rangos de heterosigocidad observada y esperada resultaron mayores para MTcCIR12 con 0.437 y 0.81 respectivamente; La media general del contenido de información polimórfica (CIP) e Índice de Shannon para todos los locus es de 0.87 y 1.37 respectivamente; el análisis molecular de varianza reveló que las diferencias genéticas dentro de los grupos (85%), mayor que las diferencias entre grupos (15%). En el análisis de componentes principales (PCA) se encontró cacaos colectados que resultaron genéticamente parecidos a los criollos referencias, es el caso de RSJ0211, RSJ 0311, RSJ 0511, Bomat0510, Ji0210; los materiales Ji-Cuá 0104 y RSJ0411 están estrechamente relacionados. Se demostró que existe una alta diversidad genética y que existen materiales promisorios para posteriores estudios de mejora genética Universidad Nacional Agraria 2015 Article PeerReviewed text es cc_by_nc_sa https://repositorio.una.edu.ni/3958/1/ppf30h565d.pdf Herrera García, Kenia, Aragón Obando, Erwin and Aguilar Bustamante, Víctor (2015) Diversidad genética en 105 accesiones de cacao (Theobroma cacao L.) colectadas en Nicaragua, utilizando 10 marcadores moleculares tipo SSR. La Calera, 15 (25). pp. 54-62. ISSN 1998-7846 https://lacalera.una.edu.ni
institution Universidad Nacional Agraria
collection Repositorio UNA-Nicaragua
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topic F30 Genética vegetal y fitomejoramiento
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Herrera García, Kenia
Aragón Obando, Erwin
Aguilar Bustamante, Víctor
Diversidad genética en 105 accesiones de cacao (Theobroma cacao L.) colectadas en Nicaragua, utilizando 10 marcadores moleculares tipo SSR
description Se realizó una caracterización molecular a 105 accesiones de cacao de 79 colectas nacionales, 21 híbridos de referencia y cinco materiales criollos de referencia agrupados en ocho grupos (Rio San Juan, Criollos referencia, híbridos referencia, Carazo, Rivas, Matagalpa, Jinotega y RAAS), utilizando 10 marcadores moleculares tipo SSR con el objetivo de conocer la diversidad genética del cacao colectado en fincas de productores nicaragüenses. Se utilizó el método de extracción de ADN CTAB-Búfer, amplificación de fragmentos de ADN mediante la técnica de la cadena de reacción de la polimerasa (PCR), visualización de fragmentos de ADN en cámara electroforesis. Se identificaron 183 alelos en las 105 accesiones con una media de 18.3, los rangos de heterosigocidad observada y esperada resultaron mayores para MTcCIR12 con 0.437 y 0.81 respectivamente; La media general del contenido de información polimórfica (CIP) e Índice de Shannon para todos los locus es de 0.87 y 1.37 respectivamente; el análisis molecular de varianza reveló que las diferencias genéticas dentro de los grupos (85%), mayor que las diferencias entre grupos (15%). En el análisis de componentes principales (PCA) se encontró cacaos colectados que resultaron genéticamente parecidos a los criollos referencias, es el caso de RSJ0211, RSJ 0311, RSJ 0511, Bomat0510, Ji0210; los materiales Ji-Cuá 0104 y RSJ0411 están estrechamente relacionados. Se demostró que existe una alta diversidad genética y que existen materiales promisorios para posteriores estudios de mejora genética
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