Vista Equipo: Molecular characterization of two accessions of Cydonia oblonga

Molecular characterization of two accessions of Cydonia oblonga

Artículo científico

Autores Principales:	Alvarado-Marchena, Luis, Flores-Mora, Dora María, Chacón-Cerdas, Randall, Schmidt-Durán, Alexander, Alvarado-Ulloa, Carlos
Formato:	Artículo
Idioma:	Español
Publicado:	Revista Agronomía Mesoamericana 2018
Materias:	Filogenética Membrillero Polimorfismo Research Subject Categories::FORESTRY, AGRICULTURAL SCIENCES and LANDSCAPE PLANNING::Plant production::Agronomy Marcadores > Moléculas Capacidad de discriminación Phylogenetics Markers > Molecules Polymorphism Discrimination capacity
Acceso en línea:	https://revistas.ucr.ac.cr/index.php/agromeso/article/view/19329 https://hdl.handle.net/2238/9614

id	RepoTEC9614
recordtype	dspace
spelling	RepoTEC96142023-10-13T17:23:04Z Molecular characterization of two accessions of Cydonia oblonga Caracterización Molecular de Dos Accesiones de Cydonia Oblonga Alvarado-Marchena, Luis Flores-Mora, Dora María Chacón-Cerdas, Randall Schmidt-Durán, Alexander Alvarado-Ulloa, Carlos Filogenética Membrillero Polimorfismo Research Subject Categories::FORESTRY, AGRICULTURAL SCIENCES and LANDSCAPE PLANNING::Plant production::Agronomy Marcadores -- Moléculas Capacidad de discriminación Phylogenetics Markers -- Molecules Polymorphism Discrimination capacity Artículo científico El objetivo de la presente investigación fue evaluar el uso del espaciador plastídico trnH-psbA y la secuencia codificante matK como posibles marcadores para la caracterización molecular de dos accesiones de membrillo (C. oblonga). Estas provinieron de Argentina y de Costa Rica. El trabajo se llevó a cabo en el Centro de Investigación en Biotecnología del Instituto Tecnológico de Costa Rica (ITCR), durante el año 2014. Los productos amplificados fueron analizados con el software MEGA v6.0 para calcular las distancias genéticas mediante el modelo de Tamura-Nei. Se determinó que la secuencia matK fue la que presentó el mayor porcentaje de sitios variables y distancia intraespecífica, indicando la presencia de polimorfismos entre las accesiones. Por otro lado, la utilización del espaciador trnH-psbA para membrillo, tuvo poca capacidad de discriminación debido a que a nivel intraespecífico este locus presentó menos divergencias. The purpose of this research was to evaluate the plastid trnH-psbA spacer and the matK coding sequence as possible markers for the molecular characterization in two accessions of quince (C. oblonga), one from Argentina and the other one from Costa Rica. The study was carried out at Center for Biotechnology Research (CIB in Spanish) of the Technological Institute of Costa Rica (ITCR, in Spanish) during 2014. Amplified products were analyzed using MEGA v6.0 software to calculate genetic distances using the Tamura-Nei model.The results showed that the matK sequence presented the highest percentage of variable sites and the highest intraspecific distance, suggesting the presence of polymorphisms between the two accessions. On the other hand, the trnH-psbA spacer for quince had a low ability to discriminate because, at intraspecific level, this locus showed less differences. 2018-02-27T20:53:53Z 2018-02-27T20:53:53Z 2015 info:eu-repo/semantics/article https://revistas.ucr.ac.cr/index.php/agromeso/article/view/19329 2215-3608 https://hdl.handle.net/2238/9614 spa https://dx.doi.org/10.15517/am.v26i2.19329 https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/ application/pdf Revista Agronomía Mesoamericana Revista Agronomía Mesoamericana
institution	Tecnológico de Costa Rica
collection	Repositorio TEC
language	Español
topic	Filogenética Membrillero Polimorfismo Research Subject Categories::FORESTRY, AGRICULTURAL SCIENCES and LANDSCAPE PLANNING::Plant production::Agronomy Marcadores -- Moléculas Capacidad de discriminación Phylogenetics Markers -- Molecules Polymorphism Discrimination capacity
spellingShingle	Filogenética Membrillero Polimorfismo Research Subject Categories::FORESTRY, AGRICULTURAL SCIENCES and LANDSCAPE PLANNING::Plant production::Agronomy Marcadores -- Moléculas Capacidad de discriminación Phylogenetics Markers -- Molecules Polymorphism Discrimination capacity Alvarado-Marchena, Luis Flores-Mora, Dora María Chacón-Cerdas, Randall Schmidt-Durán, Alexander Alvarado-Ulloa, Carlos Molecular characterization of two accessions of Cydonia oblonga
description	Artículo científico
format	Artículo
author	Alvarado-Marchena, Luis Flores-Mora, Dora María Chacón-Cerdas, Randall Schmidt-Durán, Alexander Alvarado-Ulloa, Carlos
author_sort	Alvarado-Marchena, Luis
title	Molecular characterization of two accessions of Cydonia oblonga
title_short	Molecular characterization of two accessions of Cydonia oblonga
title_full	Molecular characterization of two accessions of Cydonia oblonga
title_fullStr	Molecular characterization of two accessions of Cydonia oblonga
title_full_unstemmed	Molecular characterization of two accessions of Cydonia oblonga
title_sort	molecular characterization of two accessions of cydonia oblonga
publisher	Revista Agronomía Mesoamericana
publishDate	2018
url	https://revistas.ucr.ac.cr/index.php/agromeso/article/view/19329 https://hdl.handle.net/2238/9614
_version_	1796140084808908800
score	12.041272

Molecular characterization of two accessions of Cydonia oblonga

Ejemplares similares